Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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TMEM258P61165 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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TMEM258P61165 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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TMEM258P61165 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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TMEM258P61165 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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TMEM258P61165 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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TMEM258P61165 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TMEM258P61165 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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