Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S2P59780 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AP3S2P59780 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AP3S2P59780 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AP3S2P59780 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AP3S2P59780 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AP3S2P59780 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AP3S2P59780 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AP3S2P59780 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AP3S2P59780 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AP3S2P59780 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AP3S2P59780 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AP3S2P59780 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AP3S2P59780 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms