Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2A1P52655 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms