Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLK3P07288 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLK3P07288 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLK3P07288 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms