Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PDE6DO43924 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PDE6DO43924 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PDE6DO43924 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PDE6DO43924 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PDE6DO43924 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PDE6DO43924 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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