Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COCHO43405 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COCHO43405 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COCHO43405 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COCHO43405 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COCHO43405 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COCHO43405 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COCHO43405 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COCHO43405 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COCHO43405 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COCHO43405 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COCHO43405 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COCHO43405 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COCHO43405 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COCHO43405 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms