Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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