Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM247A6NEH6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms