Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC31BQ9NQW1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms