Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMURF2Q9HAU4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms