Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms