Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEST3Q8N1M1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms