Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP27-1Q3LI81 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms