Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A1P68400 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms