Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL1P40616 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL1P40616 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL1P40616 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms