Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms