Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP9YO00507 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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USP9YO00507 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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USP9YO00507 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP9YO00507 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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