Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP17L13C9JLJ4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms