Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NOTOA8MTQ0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms