Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPACA6W5XKT8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPACA6W5XKT8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPACA6W5XKT8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPACA6W5XKT8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPACA6W5XKT8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPACA6W5XKT8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPACA6W5XKT8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms