Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCTD3Q9Y597 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD3Q9Y597 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD3Q9Y597 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms