Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4U1

MMACHC, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type C protein, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMACHCQ9Y4U1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMACHCQ9Y4U1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMACHCQ9Y4U1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms