Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KNSTRNQ9Y448 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KNSTRNQ9Y448 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
KNSTRNQ9Y448 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms