Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDGFL3Q9Y3E1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDGFL3Q9Y3E1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms