Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC1Q9Y3B2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC1Q9Y3B2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC1Q9Y3B2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC1Q9Y3B2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC1Q9Y3B2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC1Q9Y3B2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms