Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP3Q9Y228 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms