Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
SHANK2Q9UPX8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SHANK2Q9UPX8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHANK2Q9UPX8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SHANK2Q9UPX8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms