Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
AGAP1Q9UPQ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGAP1Q9UPQ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms