Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIMKLBQ9ULI2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms