Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRFN2Q9ULH4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRFN2Q9ULH4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRFN2Q9ULH4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.1 ms