Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PNMA3Q9UL41 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PNMA3Q9UL41 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA3Q9UL41 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA3Q9UL41 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA3Q9UL41 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA3Q9UL41 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA3Q9UL41 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PNMA3Q9UL41 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PNMA3Q9UL41 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PNMA3Q9UL41 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNMA3Q9UL41 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA3Q9UL41 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms