Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ3

GPATCH8, G patch domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH8Q9UKJ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
GPATCH8Q9UKJ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.53■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
GPATCH8Q9UKJ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
GPATCH8Q9UKJ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GPATCH8Q9UKJ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms