Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNOT7Q9UIV1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNOT7Q9UIV1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNOT7Q9UIV1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNOT7Q9UIV1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNOT7Q9UIV1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNOT7Q9UIV1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNOT7Q9UIV1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNOT7Q9UIV1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNOT7Q9UIV1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNOT7Q9UIV1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms