Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HERC5Q9UII4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HERC5Q9UII4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms