Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUFIP1Q9UHK0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUFIP1Q9UHK0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms