Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL3Q9UH77 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL3Q9UH77 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL3Q9UH77 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms