Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBGCP4Q9UGJ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP4Q9UGJ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUBGCP4Q9UGJ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP4Q9UGJ1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms