Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CFDP1Q9UEE9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CFDP1Q9UEE9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.38■■■■□ 3.58
CFDP1Q9UEE9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CFDP1Q9UEE9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms