Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNMT3BQ9UBC3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT3BQ9UBC3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms