Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP36Q9P275 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP36Q9P275 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP36Q9P275 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms