Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PHRF1Q9P1Y6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PHRF1Q9P1Y6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PHRF1Q9P1Y6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms