Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXXC1Q9P0U4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXXC1Q9P0U4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXXC1Q9P0U4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXXC1Q9P0U4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms