Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A1Q9NY26 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC39A1Q9NY26 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms