Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PANK4Q9NVE7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PANK4Q9NVE7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PANK4Q9NVE7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms