Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJB4Q9NTQ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB4Q9NTQ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
GJB4Q9NTQ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB4Q9NTQ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB4Q9NTQ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJB4Q9NTQ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJB4Q9NTQ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJB4Q9NTQ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJB4Q9NTQ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJB4Q9NTQ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJB4Q9NTQ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GJB4Q9NTQ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms