Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
RRP7BPQ9NSQ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RRP7BPQ9NSQ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RRP7BPQ9NSQ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms