Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A11Q9NSA0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC22A11Q9NSA0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A11Q9NSA0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms