Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS45Q9NRW7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS45Q9NRW7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS45Q9NRW7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms