Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CYLDQ9NQC7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYLDQ9NQC7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
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