Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX9Q9NQ69 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LHX9Q9NQ69 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms